MySQL的InnoDB IO子系统知识点有哪些

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本篇内容介绍了“MySQL 的 InnoDB IO 子系统知识点有哪些”的有关知识,在实际案例的操作过程中,不少人都会遇到这样的困境,接下来就让丸趣 TV 小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧!希望大家仔细阅读,能够学有所成!

基础知识

WAL 技术 : 日志先行技术,基本所有的数据库,都使用了这个技术。简单的说,就是需要写数据块的时候,数据库前台线程把对应的日志先写(批量顺序写)到磁盘上,然后就告诉客户端操作成功,至于真正写数据块的操作(离散随机写)则放到后台 IO 线程中。使用了这个技术,虽然多了一个磁盘写入操作,但是由于日志是批量顺序写,效率很高,所以客户端很快就能得到相应。此外,如果在真正的数据块落盘之前,数据库奔溃,重启时候,数据库可以使用日志来做崩溃恢复,不会导致数据丢失。

数据预读 : 与数据块 A“相邻”的数据块 B 和 C 在 A 被读取的时候,B 和 C 也会有很大的概率被读取,所以可以在读取 B 的时候,提前把他们读到内存中,这就是数据预读技术。这里说的相邻有两种含义,一种是物理上的相邻,一种是逻辑上的相邻。底层数据文件中相邻,叫做物理上相邻。如果数据文件中不相邻,但是逻辑上相邻(id= 1 的数据和 id= 2 的数据,逻辑上相邻,但是物理上不一定相邻,可能存在同一个文件中不同的位置),则叫逻辑相邻。

文件打开模式 : Open 系统调用常见的模式主要三种:O_DIRECT,O_SYNC 以及 default 模式。O_DIRECT 模式表示后续对文件的操作不使用文件系统的缓存,用户态直接操作设备文件,绕过了内核的缓存和优化,从另外一个角度来说,使用 O_DIRECT 模式进行写文件,如果返回成功,数据就真的落盘了(不考虑磁盘自带的缓存),使用 O_DIRECT 模式进行读文件,每次读操作是真的从磁盘中读取,不会从文件系统的缓存中读取。O_SYNC 表示使用操作系统缓存,对文件的读写都经过内核,但是这个模式还保证每次写数据后,数据一定落盘。default 模式与 O_SYNC 模式类似,只是写数据后不保证数据一定落盘,数据有可能还在文件系统中,当主机宕机,数据有可能丢失。

此外,写操作不仅需要修改或者增加的数据落盘,而且还需要文件元信息落盘,只有两部分都落盘了,才能保证数据不丢。O_DIRECT 模式不保证文件元信息落盘(但大部分文件系统都保证,Bug #45892),因此如果不做其他操作,用 O_DIRECT 写文件后,也存在丢失的风险。O_SYNC 则保证数据和元信息都落盘。default 模式两种数据都不保证。

调用函数 fsync 后,能保证数据和日志都落盘,因此使用 O_DIRECT 和 default 模式打开的文件,写完数据,需要调用 fsync 函数。

同步 IO : 我们常用的 read/write 函数(Linux 上)就是这类 IO,特点是,在函数执行的时候,调用者会等待函数执行完成,而且没有消息通知机制,因为函数返回了,就表示操作完成了,后续直接检查返回值就可知道操作是否成功。这类 IO 操作,编程比较简单,在同一个线程中就能完成所有操作,但是需要调用者等待,在数据库系统中,比较适合急需某些数据的时候调用,例如 WAL 中日志必须在返回客户端前落盘,则进行一次同步 IO 操作。

异步 IO : 在数据库中,后台刷数据块的 IO 线程,基本都使用了异步 IO。数据库前台线程只需要把刷块请求提交到异步 IO 的队列中即可返回做其他事情,而后台线程 IO 线程,则定期检查这些提交的请求是否已经完成,如果完成再做一些后续处理工作。同时异步 IO 由于常常是一批一批的请求提交,如果不同请求访问同一个文件且偏移量连续,则可以合并成一个 IO 请求。例如,*** 个请求读取文件 1,偏移量 100 开始的 200 字节数据,第二个请求读取文件 1,偏移量 300 开始的 100 字节数据,则这两个请求可以合并为读取文件 1,偏移量 100 开始的 300 字节数据。数据预读中的逻辑预读也常常使用异步 IO 技术。

目前 Linux 上的异步 IO 库,需要文件使用 O_DIRECT 模式打开,且数据块存放的内存地址、文件读写的偏移量和读写的数据量必须是文件系统逻辑块大小的整数倍,文件系统逻辑块大小可以使用类似 sudo blockdev –getss /dev/sda5 的语句查询。如果上述三者不是文件系统逻辑块大小的整数倍,则在调用读写函数时候会报错 EINVAL,但是如果文件不使用 O_DIRECT 打开,则程序依然可以运行,只是退化成同步 IO,阻塞在 io_submit 函数调用上。

InnoDB 常规 IO 操作以及同步 IO

在 InnoDB 中,如果系统有 pread/pwrite 函数(os_file_read_func 和 os_file_write_func),则使用它们进行读写,否则使用 lseek+read/write 方案。这个就是 InnoDB 同步 IO。查看 pread/pwrite 文档可知,这两个函数不会改变文件句柄的偏移量且线程安全,所以多线程环境下推荐使用,而 lseek+read/write 方案则需要自己使用互斥锁保护,在高并发情况下,频繁的陷入内核态,对性能有一定影响。

在 InnoDB 中,使用 open 系统调用打开文件 (os_file_create_func),模式方面除了 O_RDONLY(只读),O_RDWR(读写),O_CREAT(创建文件) 外,还使用了 O_EXCL(保证是这个线程创建此文件)和 O_TRUNC(清空文件)。默认情况下(数据库不设置为只读模式),所有文件都以 O_RDWR 模式打开。innodb_flush_method 这个参数比较重要,重点介绍一下:

如果 innodb_flush_method 设置了 O_DSYNC,日志文件 (ib_logfileXXX) 使用 O_SYNC 打开,因此写完数据不需要调用函数 fsync 刷盘,数据文件 (ibd) 使用 default 模式打开,因此写完数据需要调用 fsync 刷盘。

如果 innodb_flush_method 设置了 O_DIRECT,日志文件 (ib_logfileXXX) 使用 default 模式打开,写完数据需要调用 fsync 函数刷盘,数据文件 (ibd) 使用 O_DIRECT 模式打开,写完数据需要调用 fsync 函数刷盘。

如果 innodb_flush_method 设置了 fsync 或者不设置,数据文件和日志文件都使用 default 模式打开,写完数据都需要使用 fsync 来刷盘。

如果 innodb_flush_method 设置为 O_DIRECT_NO_FSYNC,文件打开方式与 O_DIRECT 模式类似,区别是,数据文件写完后,不调用 fsync 函数来刷盘,主要针对 O_DIRECT 能保证文件的元数据也落盘的文件系统。

InnoDB 目前还不支持使用 O_DIRECT 模式打开日志文件,也不支持使用 O_SYNC 模式打开数据文件。

注意,如果使用 linux native aio(详见下一节),innodb_flush_method 一定要配置成 O_DIRECT,否则会退化成同步 IO(错误日志中不会有任务提示)。

InnoDB 使用了文件系统的文件锁来保证只有一个进程对某个文件进行读写操作(os_file_lock),使用了建议锁(Advisory locking),而不是强制锁(Mandatory locking),因为强制锁在不少系统上有 bug,包括 linux。在非只读模式下,所有文件打开后,都用文件锁锁住。

InnoDB 中目录的创建使用递归的方式(os_file_create_subdirs_if_needed 和 os_file_create_directory)。例如,需要创建 /a/b/c/ 这个目录,先创建 c,然后 b,然后 a,创建目录调用 mkdir 函数。此外,创建目录上层需要调用 os_file_create_simple_func 函数,而不是 os_file_create_func,需要注意一下。

InnoDB 也需要临时文件,临时文件的创建逻辑比较简单(os_file_create_tmpfile),就是在 tmp 目录下成功创建一个文件后直接使用 unlink 函数释放掉句柄,这样当进程结束后(不管是正常结束还是异常结束),这个文件都会自动释放。InnoDB 创建临时文件,首先复用了 server 层函数 mysql_tmpfile 的逻辑,后续由于需要调用 server 层的函数来释放资源,其又调用 dup 函数拷贝了一份句柄。

如果需要获取某个文件的大小,InnoDB 并不是去查文件的元数据 (stat 函数),而是使用 lseek(file, 0, SEEK_END) 的方式获取文件大小,这样做的原因是防止元信息更新延迟导致获取的文件大小有误。

InnoDB 会预分配一个大小给所有新建的文件(包括数据和日志文件),预分配的文件内容全部置为零(os_file_set_size),当前文件被写满时,再进行扩展。此外,在日志文件创建时,即 install_db 阶段,会以 100MB 的间隔在错误日志中输出分配进度。

总体来说,常规 IO 操作和同步 IO 相对比较简单,但是在 InnoDB 中,数据文件的写入基本都用了异步 IO。

InnoDB 异步 IO

由于 MySQL 诞生在 Linux native aio 之前,所以在 MySQL 异步 IO 的代码中,有两种实现异步 IO 的方案。

*** 种是原始的 Simulated aio,InnoDB 在 Linux native air 被 import 进来之前以及某些不支持 air 的系统上,自己模拟了一条 aio 的机制。异步读写请求提交时,仅仅把它放入一个队列中,然后就返回,程序可以去做其他事情。后台有若干异步 io 处理线程 (innobase_read_io_threads 和 innobase_write_io_threads 这两个参数控制) 不断从这个队列中取出请求,然后使用同步 IO 的方式完成读写请求以及读写完成后的工作。

另外一种就是 Native aio。目前在 linux 上使用 io_submit,io_getevents 等函数完成 (不使用 glibc aio,这个也是模拟的)。提交请求使用 io_submit, 等待请求使用 io_getevents。另外,window 平台上也有自己对应的 aio,这里就不介绍了,如果使用了 window 的技术栈,数据库应该会选用 sqlserver。目前,其他平台(Linux 和 window 之外) 都只能使用 Simulate aio。

首先介绍一下一些通用的函数和结构,接下来分别详细介绍一下 Simulate alo 和 Linux 上的 Native aio。

在 os0file.cc 中定义了全局数组,类型为 os_aio_array_t,这些数组就是 Simulate aio 用来缓存读写请求的队列,数组的每一个元素是 os_aio_slot_t 类型,里面记录了每个 IO 请求的类型,文件的 fd,偏移量,需要读取的数据量,IO 请求发起的时间,IO 请求是否已经完成等。另外,Linux native io 中的 struct iocb 也在 os_aio_slot_t 中。数组结构 os_aio_slot_t 中,记录了一些统计信息,例如有多少数据元素 (os_aio_slot_t) 已经被使用了,是否为空,是否为满等。这样的全局数组一共有 5 个,分别用来保存数据文件读异步请求 (os_aio_read_array),数据文件写异步请求(os_aio_write_array),日志文件写异步请求(os_aio_log_array),insert buffer 写异步请求(os_aio_ibuf_array),数据文件同步读写请求(os_aio_sync_array)。日志文件的数据块写入是同步 IO,但是这里为什么还要给日志写分配一个异步请求队列(os_aio_log_array) 呢?原因是,InnoDB 日志文件的日志头中,需要记录 checkpoint 的信息,目前 checkpoint 信息的读写还是用异步 IO 来实现的,因为不是很紧急。在 window 平台中,如果对特定文件使用了异步 IO,就这个文件就不能使用同步 IO 了,所以引入了数据文件同步读写请求队列(os_aio_sync_array)。日志文件不需要读异步请求队列,因为只有在做奔溃恢复的时候日志才需要被读取,而做崩溃恢复的时候,数据库还不可用,因此完全没必要搞成异步读取模式。这里有一点需要注意,不管变量 innobase_read_io_threads 和 innobase_write_io_threads 两个参数是多少,os_aio_read_array 和 os_aio_write_array 都只有一个,只不过数据中的 os_aio_slot_t 元素会相应增加,在 linux 中,变量加 1,元素数量增加 256。例如,innobase_read_io_threads=4,则 os_aio_read_array 数组被分成了四部分,每一个部分 256 个元素,每个部分都有自己独立的锁、信号量以及统计变量,用来模拟 4 个线程,innobase_write_io_threads 类似。从这里我们也可以看出,每个异步 read/write 线程能缓存的读写请求是有上限的,即为 256,如果超过这个数,后续的异步请求需要等待。256 可以理解为 InnoDB 层对异步 IO 并发数的控制,而在文件系统层和磁盘层面也有长度限制,分别使用 cat /sys/block/sda/queue/nr_requests 和 cat /sys/block/sdb/queue/nr_requests 查询。

os_aio_init 在 InnoDB 启动的时候调用,用来初始化各种结构,包括上述的全局数组,还有 Simulate aio 中用的锁和互斥量。os_aio_free 则释放相应的结构。os_aio_print_XXX 系列的函数用来输出 aio 子系统的状态,主要用在 show engine innodb status 语句中。

Simulate aio

Simulate aio 相对 Native aio 来说,由于 InnoDB 自己实现了一套模拟机制,相对比较复杂。

入口函数为 os_aio_func,在 debug 模式下,会校验一下参数,例如数据块存放的内存地址、文件读写的偏移量和读写的数据量是否是 OS_FILE_LOG_BLOCK_SIZE 的整数倍,但是没有检验文件打开模式是否用了 O_DIRECT,因为 Simulate aio 最终都是使用同步 IO,没有必要一定要用 O_DIRECT 打开文件。

校验通过后,就调用 os_aio_array_reserve_slot,作用是把这个 IO 请求分配到某一个后台 io 处理线程 (innobase_xxxx_io_threads 分配的,但其实是在同一个全局数组中) 中,并把 io 请求的相关信息记录下来,方便后台 io 线程处理。如果 IO 请求类型相同,请求同一个文件且偏移量比较接近(默认情况下,偏移量差别在 1M 内),则 InnoDB 会把这两个请求分配到同一个 io 线程中,方便在后续步骤中 IO 合并。

提交 IO 请求后,需要唤醒后台 io 处理线程,因为如果后台线程检测到没有 IO 请求,会进入等待状态(os_event_wait)。

至此,函数返回,程序可以去干其他事情了,后续的 IO 处理交给后台线程了。

介绍一下后台 IO 线程怎么处理的。

InnoDB 启动时,后台 IO 线程会被启动(io_handler_thread)。其会调用 os_aio_simulated_handle 从全局数组中取出 IO 请求,然后用同步 IO 处理,结束后,需要做收尾工作,例如,如果是写请求的话,则需要在 buffer pool 中把对应的数据页从脏页列表中移除。

os_aio_simulated_handle 首先需要从数组中挑选出某个 IO 请求来执行,挑选算法并不是简单的先进先出,其挑选所有请求中 offset 最小的请求先处理,这样做是为了后续的 IO 合并比较方便计算。但是这也容易导致某些 offset 特别大的孤立请求长时间没有被执行到,也就是饿死,为了解决这个问题,在挑选 IO 请求之前,InnoDB 会先做一次遍历,如果发现有请求是 2s 前推送过来的(也就是等待了 2s),但是还没有被执行,就优先执行最老的请求,防止这些请求被饿死,如果有两个请求等待时间相同,则选择 offset 小的请求。

os_aio_simulated_handle 接下来要做的工作就是进行 IO 合并,例如,读请求 1 请求的是 file1,offset100 开始的 200 字节,读请求 2 请求的是 file1,offset300 开始的 100 字节,则这两个请求可以合并为一个请求:file1,offset100 开始的 300 字节,IO 返回后,再把数据拷贝到原始请求的 buffer 中就可以了。写请求也类似,在写操作之前先把需要写的数据拷贝到一个临时空间,然后一次写完。注意,只有在 offset 连续的情况下 IO 才会合并,有间断或者重叠都不会合并,一模一样的 IO 请求也不会合并,所以这里可以算是一个可优化的点。

os_aio_simulated_handle 如果发现现在没有 IO 请求,就会进入等待状态,等待被唤醒

综上所述,可以看出 IO 请求是一个一个的 push 的对立面,每 push 进一个后台线程就拿去处理,如果后台线程优先级比较高的话,IO 合并效果可能比较差,为了解决这个问题,Simulate aio 提供类似组提交的功能,即一组 IO 请求提交后,才唤醒后台线程,让其统一进行处理,这样 IO 合并的效果会比较好。但这个依然有点小问题,如果后台线程比较繁忙的话,其就不会进入等待状态,也就是说只要请求进入了队列,就会被处理。这个问题在下面的 Native aio 中可以解决。

总体来说,InnoDB 实现的这一套模拟机制还是比较安全可靠的,如果平台不支持 Native aio 则使用这套机制来读写数据文件。

Linux native aio

如果系统安装了 libaio 库且在配置文件里面设置了 innodb_use_native_aio=on 则启动时候会使用 Native aio。

入口函数依然为 os_aio_func,在 debug 模式下,依然会检查传入的参数,同样不会检查文件是否以 O_DIRECT 模式打开,这算是一个有点风险的点,如果用户不知道 linux native aio 需要使用 O_DIRECT 模式打开文件才能发挥出 aio 的优势,那么性能就不会达到预期。建议在此处做一下检查,有问题输出到错误日志。

检查通过之后,与 Simulated aio 一样,调用 os_aio_array_reserve_slot,把 IO 请求分配给后台线程,分配算法也考虑了后续的 IO 合并,与 Simulated aio 一样。不同之处,主要是需要用 IO 请求的参数初始化 iocb 这个结构。IO 请求的相关信息除了需要初始化 iocb 外,也需要在全局数组的 slot 中记录一份,主要是为了在 os_aio_print_XXX 系列函数中统计方便。

调用 io_submit 提交请求。

至此,函数返回,程序可以去干其他事情了,后续的 IO 处理交给后台线程了。

接下来是后台 IO 线程。

与 Simulate aio 类似,后台 IO 线程也是在 InnoDB 启动时候启动。如果是 Linux native aio,后续会调用 os_aio_linux_handle 这个函数。这个函数的作用与 os_aio_simulated_handle 类似,但是底层实现相对比较简单,其仅仅调用 io_getevents 函数等待 IO 请求完成。超时时间为 0.5s,也就是说如果即使 0.5 内没有 IO 请求完成,函数也会返回,继续调用 io_getevents 等待,当然在等待前会判断一下服务器是否处于关闭状态,如果是则退出。

在分发 IO 线程时,尽量把相邻的 IO 放在一个线程内,这个与 Simulate aio 类似,但是后续的 IO 合并操作,Simulate aio 是自己实现,Native aio 则交给内核完成了,因此代码比较简单。

还要一个区别是,当没有 IO 请求的时候,Simulate aio 会进入等待状态,而 Native aio 则会每 0.5 秒醒来一次,做一些检查工作,然后继续等待。因此,当有新的请求来时,Simulated aio 需要用户线程唤醒,而 Native aio 不需要。此外,在服务器关闭时,Simulate aio 也需要唤醒,Native aio 则不需要。

可以发现,Native aio 与 Simulate aio 类似,请求也是一个一个提交,然后一个一个处理,这样会导致 IO 合并效果比较差。Facebook 团队提交了一个 Native aio 的组提交优化:把 IO 请求首先缓存,等 IO 请求都到了之后,再调用 io_submit 函数,一口气提交先前的所有请求(io_submit 可以一次提交多个请求),这样内核就比较方便做 IO 优化。Simulate aio 在 IO 线程压力大的情况下,组提交优化会失效,而 Native aio 则不会。注意,组提交优化,不能一口气提交太多,如果超过了 aio 等待队列长度,会强制发起一次 io_submit。

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正文完
 
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